Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim5E9PV98 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms