Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc8D3YZV8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms