Protein–RNA interactions for Protein: D3YU50

Mybpc1, Myosin-binding protein C, slow-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc1D3YU50 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mybpc1D3YU50 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mybpc1D3YU50 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mybpc1D3YU50 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mybpc1D3YU50 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mybpc1D3YU50 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mybpc1D3YU50 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms