Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11bB4XVQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf11bB4XVQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms