Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn2B2RVW2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms