Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms