Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apba1B2RUJ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apba1B2RUJ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms