Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms