Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zbed5B2RPU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed5B2RPU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed5B2RPU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms