Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Plekhd1B2RPU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Plekhd1B2RPU2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Plekhd1B2RPU2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms