Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm438B1ASB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm438B1ASB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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