Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prr29B1ARI9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prr29B1ARI9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prr29B1ARI9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms