Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b5A3FIN4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b5A3FIN4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8b5A3FIN4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp8b5A3FIN4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms