Protein–RNA interactions for Protein: A2RT62

Fbxl16, F-box/LRR-repeat protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxl16A2RT62 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxl16A2RT62 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxl16A2RT62 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms