Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2al1jA2BFR3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2al1jA2BFR3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms