Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef25A2ASI9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef25A2ASI9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms