Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramel3A2AHA7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel3A2AHA7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel3A2AHA7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms