Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd5A2A8L1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms