Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsg1A2A825 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsg1A2A825 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms