Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv12-2A0A0B4J1H1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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