Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B020011L13RikA0A087WQI7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
B020011L13RikA0A087WQI7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
B020011L13RikA0A087WQI7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms