Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms