Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tulp1Q9Z273 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms