Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn6Q9Z262 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms