Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trip6Q9Z1Y4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trip6Q9Z1Y4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trip6Q9Z1Y4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms