Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nek4Q9Z1J2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek4Q9Z1J2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek4Q9Z1J2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms