Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRG3Q9Y2Y8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms