Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp46a1Q9WVK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp46a1Q9WVK8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp46a1Q9WVK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms