Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nme3Q9WV85 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nme3Q9WV85 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms