Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bgrQ9WUZ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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