Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam50bQ9WTJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam50bQ9WTJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms