Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fhl3Q9R059 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fhl3Q9R059 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms