Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Col4a3Q9QZS0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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