Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tnnt3Q9QZ47 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnnt3Q9QZ47 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt3Q9QZ47 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms