Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms