Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Foxe3Q9QY14 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxe3Q9QY14 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxe3Q9QY14 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms