Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpsf3Q9QXK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpsf3Q9QXK7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms