Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rad18Q9QXK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad18Q9QXK2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad18Q9QXK2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms