Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rad1Q9QWZ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad1Q9QWZ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms