Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdkl2Q9QUK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms