Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms