Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cabp1Q9JLK7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cabp1Q9JLK7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cabp1Q9JLK7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms