Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk3aQ9JKX8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk3aQ9JKX8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms