Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Irx5Q9JKQ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms