Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nova1Q9JKN6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nova1Q9JKN6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms