Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uchl3Q9JKB1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uchl3Q9JKB1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms