Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msgn1Q9JK54 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msgn1Q9JK54 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msgn1Q9JK54 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msgn1Q9JK54 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msgn1Q9JK54 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Msgn1Q9JK54 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msgn1Q9JK54 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msgn1Q9JK54 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms