Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc86Q9JJ89 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc86Q9JJ89 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms