Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcirg1Q9JHF5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms