Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn12Q9ET43 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn12Q9ET43 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms